治疗甲状腺疾病效果较好的医院通常需要综合考虑医院的医疗技术水平、专家团队、医疗设备、患者口碑以及医疗服务等因素。

1. 医疗技术水平：先进的医疗技术是治疗甲状腺疾病的关键。例如，具备成熟的甲状腺微创手术技术，能够减少手术创伤和并发症；在放射性碘治疗方面经验丰富，能精准控制剂量，提高治疗效果。

2. 专家团队：拥有知名的甲状腺专家，他们在甲状腺疾病的诊断和治疗方面具有深厚的造诣。如擅长甲状腺癌的早期诊断和综合治疗的专家，以及在甲亢、甲减等常见疾病治疗方面经验丰富的医生。

3. 医疗设备：先进的医疗设备如高精度的超声设备、核素显像设备等，有助于更准确地诊断甲状腺疾病，为治疗提供可靠依据。

4. 患者口碑：患者的评价能反映医院的实际治疗效果和服务质量。可以通过在线医疗平台、患者论坛等了解其他患者的就医体验。

5. 医疗服务：包括便捷的挂号流程、舒适的就医环境、贴心的护理服务等，能提升患者的就医感受，有助于患者更好地配合治疗。

综合以上因素，南昌的一些大型综合性医院，如南昌大学第一附属医院、江西省人民医院等，在甲状腺疾病的治疗方面都有较好的表现。患者可以根据自身的实际情况选择适合的医院就诊。