菏泽有不少可以治疗灰指甲的专科医院和综合医院，如菏泽皮肤病医院、菏泽市立医院、菏泽市定陶区人民医院、菏泽市中医医院、单县中心医院等。

1. 菏泽皮肤病医院：灰指甲科室是其重点打造的科室，按三级医院设置，是菏泽市大型皮肤病专科医院。该医院秉承“大医精诚 德行天下”的理念，拥有完善的医疗管理体系，设有标准化医疗服务。医院还汇集了一批国内经验丰富的皮肤科专家。

2. 菏泽市立医院：这是一所三甲公立综合医院，始建于1946年，是全市医疗、教学、科研、技术指导中心。医院皮肤科有擅长甲真菌病(灰指甲)治疗的医生，地址位于山东省菏泽市牡丹区曹州路2888号。

3. 菏泽市定陶区人民医院：二甲医保定点综合医院，可进行相关问诊，地址在山东省菏泽市定陶区站前路A段056号，能为灰指甲患者提供一定的医疗服务。

4. 菏泽市中医医院：作为三甲医保定点综合医院，有中医特色治疗方法，地址在山东省菏泽市牡丹区东城街道丹阳路1036号，可结合中医理论对灰指甲进行诊治。

5. 单县中心医院：三甲公立综合医院，中心院区位于山东省菏泽市单县文化路一号，北院区妇儿部在山东省菏泽市单县北外环路与湖西路交接处。医院科室较为齐全，能为灰指甲患者提供综合的医疗支持。

在菏泽，上述这些医院都在灰指甲治疗方面有各自的优势和特色。患者可以根据自身的实际情况，如病情严重程度、交通便利程度、个人对医院的偏好等，选择适合自己的医院进行治疗。