在三亚，选择治疗甲状腺疾病效果较好的医院，需要考虑医院的综合实力、专家团队、医疗设备、患者口碑以及特色诊疗项目等。

1.综合实力：包括医院的规模、医疗资源整合能力、多学科协作水平等。规模较大的综合性医院通常在应对复杂的甲状腺疾病时，能够调动更多的医疗资源，为患者提供全面的治疗方案。

2.专家团队：拥有经验丰富、专业素养高的甲状腺疾病专家是关键。他们能够准确诊断病情，制定个性化的治疗策略，并且在手术操作等方面具备精湛的技术。

3.医疗设备：先进的医疗设备如高精度的超声仪器、放射性核素检测仪等，有助于更精准地诊断甲状腺疾病的类型和程度，为治疗提供有力支持。

4.患者口碑：通过患者的反馈和评价，可以了解医院在服务质量、治疗效果等方面的实际表现。良好的口碑往往意味着医院在甲状腺疾病治疗方面具有较高的满意度。

5.特色诊疗项目：一些医院可能在甲状腺疾病的某些领域有独特的治疗方法或研究成果，例如甲状腺结节的微创治疗、甲状腺癌的综合治疗等。

综合考虑以上因素，建议患者可以多方面了解三亚的医院情况，也可以咨询当地的医疗管理部门或向已经接受过治疗的患者打听，以便选择最适合自己的医院进行甲状腺疾病的诊治。