肛门直肠连着疼痛可能是内痔、外痔、肛裂、肛窦炎、结核病等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.内痔

内痔位于齿状线上方，其静脉丛发生扩张、血栓或破裂，导致局部炎症和出血。当内痔脱出并受到摩擦或刺激时，会引起肛门疼痛。对于内痔引起的疼痛，可使用止痛药物如对乙酰氨基酚进行缓解。

2.外痔

外痔是由于长期坐立、便秘等原因引起肛垫下移或肥大、肛周皮下血管丛血栓形成或破裂所致。外痔可伴有瘙痒、疼痛等症状。患者可在医生指导下使用红霉素软膏、氢化可的松乳膏等药物进行治疗。

3.肛裂

肛裂通常由排便时肛管皮肤全层撕裂引起，多见于肛门后部和前正中处。肛裂会导致肛门周围出现裂缝和溃疡，引起剧烈疼痛。患者可以遵医嘱使用开塞露、甘油灌肠剂等药物进行治疗。

4.肛窦炎

肛窦炎是由细菌感染引起的肛隐窝炎症，久之形成小脓肿，破溃之后就会形成肛瘘。炎症因子刺激会导致肛门部位出现持续性疼痛感。患者可以在医生指导下使用抗生素类药膏进行治疗，比如克林霉素磷酸酯凝胶、夫西地酸钠软膏等。

5.结核病

结核病是由结核分枝杆菌感染引起的慢性传染病，若结核分枝杆菌侵犯肠道，则可能会累及到肛门直肠部位，从而诱发疼痛的症状。确诊为结核病后，需要及时配合医生通过服用抗结核药物的方式来进行规范性的治疗，比较常用的有异烟肼片、利福平胶囊等。

针对肛门直肠疼痛的情况，建议患者定期进行肛门指诊、直肠镜检以及血液分析以评估病情进展。日常生活中应保持良好的排便习惯，避免长时间憋便，以免加重不适症状。