南京治疗皮肤病比较好的医院包括中国医学科学院皮肤病医院（皮研所）、江苏省人民医院皮肤科、南京市第二医院皮肤科、南京鼓楼医院皮肤科和东南大学附属中大医院皮肤科等。

1. 中国医学科学院皮肤病医院（皮研所）：

该院是国家早成立的从事皮肤病集医、教、研、防于一体的唯1专业机构。

拥有14位临床医生，包括7位主任医师、4位副主任医师和3位主治医师，多数是国家重点学科“皮肤性病学”的专业学科带头人。

在大疱性皮肤病、银屑病、白癜风、遗传性皮肤病等疾病的基础和临床诊疗方面有着深入的研究。

2. 江苏省人民医院皮肤科：

作为一所三甲医院，其皮肤科也具备较高的诊疗水平。

拥有一批专业的皮肤科医生和先进的诊疗设备。

在皮肤病的治疗方面积累了丰富的经验。

3. 南京市第二医院皮肤科：

该院皮肤科擅长各类皮肤科常见病、多发病以及各种疑难病症的诊治。

对于性传播疾病的治疗经验丰富，尤其是对于妊娠梅毒、胎传梅毒、神经梅毒及尖锐湿疣的治疗效果好。

4. 南京鼓楼医院皮肤科：

开设了“皮肤美容专病门诊”、“银屑病专病门诊”、“甲病专病门诊”和“脱发专病门诊”等一系列特色门诊。

负责住院医师规范化培训、全科医师培训、基层医院医生进修等任务，具备较强的医学教育能力。

5. 东南大学附属中大医院皮肤科：

在疑难皮肤病性病及医学美容、银屑病、白癜风、各种疣的治疗方面具备独特的优势和治疗经验。

开展的白癜风表皮移植治疗、自血疗法、封闭治疗等特色治疗项目深受患者好评。

综上所述，南京有多家医院在皮肤病治疗方面具有较高的水平。患者可以根据自身病情和需求，选择合适的医院进行治疗。这些医院不仅拥有专业的医生和先进的设备，还在皮肤病的基础和临床诊疗方面积累了丰富的经验