南京有多家医院在治疗甲状腺疾病方面表现出色，如医疗技术水平、专家团队、医疗设备、患者口碑、医院的综合实力等。

1.医疗技术水平：先进的治疗技术是保障治疗效果的关键。例如，一些医院采用的微创手术方式，能够减少患者的创伤和恢复时间。像南京鼓楼医院，其在甲状腺疾病的治疗技术上不断创新，紧跟国际前沿。

2.专家团队：经验丰富、专业素养高的专家能为患者提供精准的诊断和个性化的治疗方案。江苏省人民医院就拥有一批知名的甲状腺疾病专家，他们在该领域深耕多年。

3.医疗设备：先进的检查和治疗设备有助于提高诊断的准确性和治疗的有效性。南京市第一医院配备了高端的甲状腺检测和治疗设备。

4.患者口碑：患者的亲身经历和评价能反映医院的实际治疗效果和服务质量。南京医科大学附属第二医院因良好的治疗效果和贴心服务，在患者中积累了不错的口碑。

5.医院的综合实力：包括医院的规模、科室设置、科研能力等。东南大学附属中大医院综合实力较强，为甲状腺疾病的治疗提供了全方位的支持。

总之，选择南京治疗甲状腺疾病的医院时，可以综合考虑以上因素，并结合自身的实际情况做出选择。建议提前了解医院的相关信息，必要时可以咨询医生或已经接受过治疗的患者。