吉安男科医院倡导全新人文服务理念，建立新型医患关系，实施“一医一患一诊室”的诊疗模式，充分尊重患者隐私权与知情同意权，并推行全程医疗质量跟踪服务。本着“一切以病人为中心”的服务宗旨，医院努力改善服务态度，优化服务流程，提高医疗质量，保护患者隐私，设身处地为患者着想。 门诊开设导医台、咨询服务台, 方便病人就诊。为方便患者，医院实行划价、收费、取药、办理出入院手续等服务。药房大厅增设电子屏幕，向患者公布药品价格、各种检查治疗收费标准。真正做到了让病人明白、放心。开设平价病房，降低药品价格，控制医疗费用，解决群众看病难、看病贵的问题。

诊治男科疾病和提供男女生殖保健的三级生殖专科医院，同时医院被列入全省职工医保、新农合定点单位及城镇医保定点单位。医院男科于2008年被省卫生厅评为“江西省医学领先学科”。

目前医院设有前列腺疾病科、生殖医学科、男性不育科、性功能康复科、性传播疾病科、生殖整形科、性心理咨询室等临床科室，还设有男性不育实验室、PCR实验室（基因扩散增检验实验室）、辅助生殖实验室等，其中男性生殖医学实验室被评为南昌市重点实验室，该实验室目前引进并开展了多个可填补省内空白的检测项目，为临床治疗提供了更科学的依据，可开展精浆洗涤、精子上游、供精人工授精（AID）、夫精人工授精（AIH）、体外受精与胚胎移植技术（试管婴儿）等辅助生殖技术以及各种男科、妇科手术，如微创包皮整形术、显微取精术及精索静脉曲张高位结扎术、睾丸下降固定术、宫腹腔镜手术等。