宫外孕术后三个月腰酸腹痛可能是由输卵管功能异常引起的。

宫外孕手术可能会对输卵管造成一定的损伤，导致输卵管功能异常，进而引起腰酸腹痛的症状。如果症状持续存在或加重，应及时就医进行进一步的诊断和治疗。

此外，还应考虑是否有附件炎、盆腔炎等疾病的存在，这些炎症也可能导致上述不适症状。患者需要及时完善B超检查以明确具体情况。

在关注腰酸腹痛的同时，应注意观察阴道有无出血等症状，并定期复查监测病情变化。若症状加剧或伴有其他不适，应立即就医以便获得适当的治疗。

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