排卵障碍内膜薄可能会影响自主怀孕。

排卵障碍可能导致黄体功能不足，进而影响子宫内膜的生长和修复，使内膜变薄。内膜过薄会减少受精卵着床的机会，从而降低怀孕的概率。此外，内膜过薄还可能导致着床不稳定，增加流产的风险。

如果患者存在多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等疾病时，可能会出现不规律排卵或持续无排卵的现象，此时则不能自主怀孕。

对于排卵障碍和内膜薄的情况，建议定期监测排卵和子宫内膜厚度，并在医生指导下使用促排卵药物改善排卵情况，同时通过营养调理和生活方式调整辅助内膜恢复。

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