月经结束后腰酸背痛和小腹痛可能是由子宫内膜异位症引起的。

子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，其发生与遗传因素、免疫因素、内分泌因素等有关。当子宫内膜细胞种植在子宫外的部位时，会引起局部炎症反应和组织纤维化，进而导致腰酸背痛和小腹痛的症状。此类病症需要通过超声检查、腹腔镜检查等来确诊，并且需要积极治疗以控制病情进展。

此外，还应考虑是否患有盆腔炎性疾病、卵巢囊肿蒂扭转或破裂等情况。这些都可能导致经期后出现腰酸背痛和小腹痛的症状。针对不同的病因，治疗方法也有所不同，因此需进行针对性处理。

总之，在关注月经周期的同时，也要留意非月经期的身体变化，若症状持续或加重，应及时就医以便明确诊断并接受适当治疗。