女性在做直肠指检时感到宫颈疼痛可能是由阴道炎、宫颈糜烂等妇科疾病导致的。

上述提及的妇科疾病会导致宫颈局部出现充血水肿的情况，此时宫颈黏膜比较脆弱，在进行直肠指检时触碰到宫颈会引起疼痛感。如果疼痛持续存在或者加剧，建议及时就医以便进行进一步的诊断和治疗。

此外，若患者有痔疮或肛裂病史，也可能在直肠指检过程中因触碰病变部位而感到宫颈疼痛。因为这些病变与直肠相邻，容易被误认为是宫颈受压所致。

因此，在进行直肠指检前，应告知医生任何不适或疑虑，并确保使用润滑剂以减少不适感。同时，保持良好的个人卫生习惯也是预防相关问题的重要措施。

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