牙周炎晚期的治疗包括基础治疗、手术治疗、修复治疗、维护期治疗、全身治疗等方面。
1. 基础治疗：首先是口腔卫生指导，教会患者正确的刷牙方法，如巴氏刷牙法，使用牙线、牙缝刷等清洁工具。然后进行龈上洁治，也就是洗牙，去除牙齿表面的牙菌斑、牙结石。龈下刮治和根面平整也至关重要，通过器械深入牙龈下方，去除牙根表面的牙石和病变组织，消除炎症，促进牙周组织的愈合。
2. 手术治疗：对于有深牙周袋、牙槽骨吸收严重的情况，可进行牙周翻瓣术。该手术将牙龈翻开，直视下彻底清除感染组织，修整牙槽骨外形，然后将牙龈复位缝合。引导组织再生术也是常用手术，通过放置生物膜等材料，引导牙周组织再生，修复受损的牙周组织。
3. 修复治疗：在牙周炎症得到基本控制后，对于牙列缺损或缺失的患者，可进行修复治疗。如活动义齿修复，它可以恢复牙齿的咀嚼功能和美观，并且制作相对简单、价格较为实惠。固定义齿修复，美观性和咀嚼效率较高，但对基牙要求较高。种植义齿修复，能较好地模拟天然牙的功能和外观，但费用相对较高且对患者的口腔局部条件和全身健康状况有一定要求。
4. 维护期治疗：定期复查是关键，一般建议每3 - 6个月复查一次。复查时进行口腔检查、牙周探诊等，根据情况进行必要的洁治等维护治疗，以巩固疗效，防止牙周炎复发。
5. 全身治疗：对于一些病情较重、炎症不易控制的患者，可考虑全身应用抗生素辅助治疗，如阿莫西林、甲硝唑、罗红霉素等。但必须在医生的指导下使用，因为抗生素的滥用可能导致耐药菌的产生等不良后果。
牙周炎晚期的治疗是一个综合性的过程，需要从基础治疗开始，根据病情的严重程度逐步选择合适的手术治疗、修复治疗等，同时配合全身治疗和定期的维护期治疗，才能较好地控制病情，提高患者的口腔健康水平。
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