亚急性咳嗽的治疗需考虑感染后咳嗽、咳嗽变异性哮喘、上气道咳嗽综合征、嗜酸粒细胞性支气管炎、胃食管反流性咳嗽等因素。
1. 感染后咳嗽：这是亚急性咳嗽最常见的原因之一。通常具有自限性。一般不需要使用抗生素治疗。可使用止咳药物来缓解症状，如右美沙芬，其通过抑制延髓咳嗽中枢而发挥中枢性镇咳作用；喷托维林，能选择性抑制咳嗽中枢，还有轻度的阿托品样作用和局麻作用；复方甘草片，其成分中的甘草流浸膏为保护性镇咳祛痰剂。
2. 咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘。治疗主要是吸入糖皮质激素，如布地奈德，它能减轻气道炎症反应；也可使用β?受体激动剂，像沙丁胺醇，可舒张支气管平滑肌；白三烯调节剂孟鲁司特也可用于治疗，能改善气道炎症。
3. 上气道咳嗽综合征：多由鼻部疾病引起。如果是鼻炎导致，可使用鼻用糖皮质激素，例如糠酸莫米松鼻喷雾剂，可减轻鼻腔炎症；口服抗组胺药如氯雷他定，能减轻鼻黏膜的过敏反应；减充血剂如伪麻黄碱，可减轻鼻黏膜充血。
4. 嗜酸粒细胞性支气管炎：主要治疗药物为吸入糖皮质激素，如氟替卡松，可减轻气道嗜酸粒细胞炎症；也可尝试口服糖皮质激素如泼尼松，但需谨慎使用，要在医生的评估和指导下进行。
5. 胃食管反流性咳嗽：生活方式调整很重要。抬高床头，避免进食过饱，避免食用辛辣、油腻、酸性食物等。药物治疗可使用质子泵抑制剂，如奥美拉唑，能抑制胃酸分泌；促胃肠动力药如多潘立酮，可促进胃排空，减少反流。
亚急性咳嗽的治疗需要明确病因，针对不同病因如感染后咳嗽、咳嗽变异性哮喘、上气道咳嗽综合征、嗜酸粒细胞性支气管炎、胃食管反流性咳嗽等采取相应的治疗措施，包括使用止咳药、吸入或口服糖皮质激素、抗组胺药、质子泵抑制剂等药物，同时在某些情况下结合生活方式的调整。在治疗过程中一定要遵循医生的建议。
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