南通有不少在治疗灰指甲方面较为知名的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通华医堂皮肤病研究院、南通市第三人民医院等。

1. 南通大学附属医院：始建于1911年，是江苏省属综合性教学医院、省级综合类医疗中心等。医院皮肤科是省级临床重点专科，拥有多位专业的皮肤科医生，在皮肤病与性病疑难杂症及结缔组织疾病的诊疗等方面经验丰富。

2. 南通市第一人民医院：是集医教研及健康管理于一体的国家三级甲等综合性医院。皮肤科专家擅长皮肤科少见病、顽固性疾病及疑难疾病的诊断和治疗，在多种皮肤病、性传播性疾病的诊断及药物、激光、手术等治疗方面也有一定经验。

3. 南通市中医院：拥有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个。外科为国家中医药管理局重点专科等，医院在疾病治疗方面有着丰富的经验，对于灰指甲的治疗可能会采用中西医结合的方法。

4. 南通华医堂皮肤病研究院：是经卫生部门批准成立的集科研、治疗、教学为一体的科研机构。皮肤科是重点科室，在皮肤病治疗上采用中西医结合、药物治疗与物理治疗相结合的特色方法，对灰指甲等常见皮肤病具有疗程短、效果显著、复发少的优势。

5. 南通市第三人民医院：为三甲公立综合医院，医院有多位皮肤科专家，其中包括主任医师和副主任医师，能为灰指甲患者提供专业的诊疗服务。

总之，南通的这些医院在治疗灰指甲方面各有优势。患者可以根据自身的实际情况，如距离远近、医院特色、专家擅长等因素，选择适合自己的医院进行治疗。同时，灰指甲患者在治疗过程中也应遵循医生的建议，积极配合治疗。

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