半夜被腰两侧疼醒可能由腰肌劳损、腰椎间盘突出症、泌尿系统结石、肾脏疾病、强直性脊柱炎等因素引起，可通过休息、药物治疗、物理治疗、手术治疗等方法缓解。
1. 腰肌劳损：长期从事弯腰工作、久坐久站等，可导致腰部肌肉慢性损伤，引发腰肌劳损。患者会出现腰部疼痛，尤其是在夜间或劳累后加重。治疗上，应注意休息，避免过度劳累，可通过热敷、按摩等物理治疗方法缓解疼痛，也可遵医嘱使用布洛芬、双氯芬酸钠、塞来昔布等非甾体抗炎药减轻炎症和疼痛。
2. 腰椎间盘突出症：腰椎间盘退变、损伤等可导致椎间盘突出，压迫周围神经，引起腰部疼痛，还可能伴有下肢放射性疼痛、麻木等症状。患者需卧床休息，可进行牵引、针灸、推拿等物理治疗。若疼痛严重，可遵医嘱使用甲钴胺营养神经，使用美洛昔康、依托考昔、萘普生等药物止痛。保守治疗无效时，可考虑手术治疗。
3. 泌尿系统结石：肾结石、输尿管结石等泌尿系统结石，在结石移动时可刺激尿路黏膜，引起腰部剧烈疼痛，疼痛通常为绞痛，可伴有血尿、恶心、呕吐等症状。较小的结石可通过多喝水、多运动促进排出，也可遵医嘱使用坦索罗辛、枸橼酸氢钾钠、别嘌醇等药物辅助排石。较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术取石。
4. 肾脏疾病：肾小球肾炎、肾盂肾炎等肾脏疾病，也可能导致腰部两侧疼痛，还可能伴有蛋白尿、水肿、发热等症状。患者应注意休息，根据病情遵医嘱使用抗生素（如阿莫西林、头孢呋辛、左氧氟沙星）、糖皮质激素（如泼尼松、甲泼尼龙）等药物进行治疗。
5. 强直性脊柱炎：这是一种慢性炎症性疾病，主要侵犯骶髂关节、脊柱等部位，患者会出现腰部疼痛、僵硬，尤其是在早晨或夜间休息后加重，活动后可缓解。治疗上，可遵医嘱使用柳氮磺吡啶、甲氨蝶呤、来氟米特等改善病情抗风湿药，以及英夫利昔单抗、阿达木单抗等生物制剂控制病情发展。同时，患者应进行适当的体育锻炼，保持脊柱的正常生理曲度。
半夜被腰两侧疼醒的原因较为复杂，不同病因的治疗方法也有所不同。当出现这种情况时，应及时就医，进行详细的检查，明确病因，并在医生的指导下进行规范治疗。同时，日常生活中要注意保持良好的姿势，避免过度劳累，加强腰部肌肉锻炼，以预防腰部疼痛的发生。
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