南京有多家医院擅长治疗癫痫，其中包括南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院等。这些医院均设有神经内科，拥有先进的医疗设备和专业的医疗团队，能够为癫痫患者提供全面的诊疗服务。

1. 南京医科大学第一附属医院：该院的神经内科是国家卫健委临床医师培训基地，江苏省临床重点专科，并设有“癫痫中心”。学科设备先进、功能齐全，集医疗、教学、科研为一体，为患者提供精准的诊断和治疗。

2. 南京鼓楼医院：神经内科为国家临床重点专科，江苏省临床重点专科，拥有癫痫与发作性疾病亚专业，配备最新的癫痫诊疗设备和诊断治疗技术，对难治性癫痫有较高的治愈率。

3. 东南大学附属中大医院：神经内科是江苏省神经病学研究中心（共建单位），江苏省医学重点学科，拥有先进的诊治设备和全面的神经系统危急重症救治技术，对癫痫等疾病的诊治具有丰富的经验。

4. 东部战区总医院：神经内科创建了国内首个网络化、区域性的南京卒中注册系统，科室拥有一系列先进精密的诊疗设备，为癫痫的诊断提供了重要的科学依据和良好的治疗指导。

5. 南京市第一医院：神经内科为南京医科大学硕士学位授予学科，对癫痫患者进行神经心理评估，提供全面精准的诊断，同时开展记忆力、注意力、语言、情绪、行为等多种量表评估，有助于明确患者受累的脑区。

南京的上述医院均具备较高的癫痫诊疗水平，患者可以根据自身情况和医院的专业特色选择合适的医院就诊，以获得最佳的治疗效果

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