睡下后直肠疼痛可能是由于异物刺激、肛裂、痔疮、结肠炎、直肠息肉等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.异物刺激

异物刺激会导致局部黏膜受损，引起炎症反应和神经反射性疼痛。如果是由粪便干结、卫生纸等引起的，可以通过使用开塞露进行缓解。

2.肛裂

肛裂是由于长期便秘或腹泻导致肛管皮肤破裂而形成的小溃疡，排便时干硬的大便会摩擦伤口，从而引起疼痛。患者可在医生指导下使用红霉素软膏、氢化可的松乳膏等药物减轻疼痛。

3.痔疮

痔核组织位于齿状线以下，在睡眠状态下体位改变可能会加重对痔核的压迫，进而诱发疼痛。患者可以遵照医生的指导使用马应龙麝香痔疮膏、云南白药痔疮膏等药物进行治疗。

4.结肠炎

结肠炎由多种原因如细菌、真菌、病毒等感染所致，炎症因子刺激肠道黏膜，当病变累及到直肠部位时，就会出现睡下后直肠疼痛的情况。患者需要及时就医并配合医生通过服用柳氮磺吡啶肠溶片、美沙拉嗪肠溶片等药物来控制病情。

5.直肠息肉

直肠息肉是指从肠黏膜表面突出至肠腔内的隆起性病变，当息肉体积较大或者位置较低时，会对周围组织产生一定的压迫作用，从而引起睡下后的直肠疼痛。对于较大的息肉，可以在内镜下进行切除术，例如高频电凝圈套器除法、活检钳摘除法等。

建议定期进行肛门指诊、大便常规以及潜血试验等检查。日常生活中注意保持良好的饮食习惯，避免食用辛辣刺激性的食物，以免加重不适症状。