在南京，有多家医院的科室可以治疗甲状腺疾病，如南京鼓楼医院的内分泌科、江苏省人民医院的甲状腺外科、南京市第一医院的核医学科、东南大学附属中大医院的甲乳外科、南京医科大学第二附属医院的普外科等。

1.南京鼓楼医院：作为一所综合性医院，其内分泌科在甲状腺疾病的诊断和治疗方面具有丰富的经验和先进的技术。拥有专业的医疗团队，能够为患者提供精准的诊断和个性化的治疗方案。

2.江苏省人民医院：甲状腺外科在甲状腺癌、甲状腺结节等疾病的手术治疗方面具备较高的水平，手术操作精细，术后康复管理完善。

3.南京市第一医院：核医学科在甲状腺疾病的放射性碘治疗方面具有独特优势，对于甲亢等疾病的治疗效果显著。

4.东南大学附属中大医院：甲乳外科在甲状腺和乳腺疾病的综合治疗方面有着出色的表现，注重多学科协作，为患者提供全面的医疗服务。

5.南京医科大学第二附属医院：普外科在甲状腺疾病的常规治疗和疑难病症的处理上积累了丰富的经验，能够为患者解决各种问题。

总之，南京有众多优秀的医院和科室可以为甲状腺疾病患者提供专业的医疗服务。患者可以根据自身的病情、距离、医院的专长等因素选择合适的医疗机构进行就诊和治疗。

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